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Une approche holistique de sélection végétale
Publications de l'ILCI
2022
- Amagloh, Flora C., Archileo N. Kaaya, Gaston A. Tumuhimbise, Arnold Katungisa, Francis K. Amagloh, et Benard Yada. 2022. "Méthodes de traitement domestique et leur impact sur les composés bioactifs et les activités antioxydantes des génotypes de patates douces de différentes couleurs de chair de racine de stockage." Antioxydants 11, no. 10 : 1867. doi.org/10.3390/antiox11101867
- Amagloh, Flora C., Archileo N. Kaaya, Benard Yada, Doreen Murenju Chelangat, Arnold Katungisa, Francis Kweku Amagloh, Gaston Ampe Tumuhimbise, Composés bioactifs et activités antioxydantes dans les racines de patate douce pelées et non pelées de différentes variétés et clones en Ouganda.Future Foods, Volume 6, 2022, 100183,ISSN 2666-8335, doi.org/10.1016/j.fufo.2022.100183.
- Amongi W, Nkalubo S, Ochwo-Ssemala M, Badji A, Dramadri O, Odongo LT, Nuwamanya E, Tukamuhabwe P, Izquierdo P, Cichy K, Kelly J and Mukankusi C. Genetic and Phenotype based Clustering, and Diversity of African Panel of Released haricot Genotypes and Breeding lines (soumis pour révision à Genetic Resources and Crop Evolution)
- Bethany Fallon Econopouly, Brandon Monier, Terry Casstevens et Francisco Agosto-Perez. Introduction à JupyterHub et aux bases de R. Ressource Web - vidéos de formation virtuelle à JupyterHub avec exercices et modules d'apprentissage.
- Hershberger, J., Mbanjo, E.G.N., Peteti, P., Ikpan, A.S., Ogunpaimo, K., Nafiu, K., Rabbi, I.Y., et Gore, M.A. 2022. Low-cost, handheld near-infrared spectroscopy for root dry matter content prediction in cassava. The Plant Phenome Journal 5:e20040. https://doi.org/10.1002/ppj2.20040. [Révision par les pairs]
- Nkouaya Mbanjo, E.G., Hershberger, J., Peteti, P., Agbona, A., Ikpan A, Ogunpaimo, K., Kayondo, S.I., Abioye, R.S., Nafiu, K., Alamu, E.O., Adesokan, M., Maziya-Dixon, B., Parkes, E., Kulakow, P., Gore, M.A., Egesi, C., et Rabbi, I.Y. 2022. Prédire la teneur en amidon des racines fraîches de manioc en utilisant la spectroscopie proche infrarouge. Frontiers in Plant Science 13:990250. doi : 10.3389/fpls.2022.990250. En attente de publication. [Révision par les pairs]
- Rife, T. W., Courtney, C., Bauchet, G., Neilsen, M., & Poland, J. A. (2022). Intercross : An Android app for sélection végétale and genetics cross management. Crop Science, 62(2), 820-824. https://doi.org/10.1002/csc2.20702. [Révision par les pairs]
- Tanaka, R., Wu, D., Li, X., Tibbs-Cortes, L.E., Wood, J.C., Magallanes-Lundback, M., Bornowski, N., Hamilton, J.P., Vaillancourt, B., Li, X., Deason, N.T., Schoenbaum, G.R., Buell, C.R., DellaPenna, D., Yu, J., et Gore, M.A. 2022. Leveraging prior biological knowledge improves prediction of tocochromanols in maize grain. The Plant Genome.
- Tibbs-Cortes, L.E., Guo, T., Li, X., Tanaka, R., Vanous, A.E., Peters, D., Gardner, C., Magallanes-Lundback, M., Deason, N.T., DellaPenna, D., Gore, M.A., et Yu, J. 2022. Prédiction génomique des tocochromanols dans le maïs d'origine exotique. https://doi.org/10.1002/essoar.10511801.1. En cours de révision. [Examen par les pairs] https://doi.org/10.1002/tpg2.20276. En attente de publication. [Révision par des pairs]
- Amod Udayanga, Leung Tang, Pushparajah Thavarajah, William Bridges, Emerson Shipe, George Vandemark, Dil Thavarajah, 2021. Les acides gras essentiels comme trait nutritionnel cible pour la biofortification du pois chiche (Cicer arietinum). Scientific Reports, Submission ID b7403f1c-77c2-42ab-b333-4d6bbeee0f0c. En cours de révision. [Révision par les pairs]
- Wu, D., Li, X., Tanaka, R., Wood, J.C., Tibbs-Cortes, L.E., Magallanes-Lundback, M., Bornowski, N., Hamilton, J.P., Vaillancourt, B., Diepenbrock, C.H., Li, X., Deason, N.T., Schoenbaum, G.R., Yu, J., Buell, C.R., DellaPenna, D., et Gore, M.A. 2022. Combinaison de GWAS et de TWAS pour identifier les gènes causaux candidats pour les niveaux de tocochromanol dans le grain de maïs. Genetics 221:iyac091. https://doi.org/10.1093/genetics/iyac091. [Révision par les pairs]
2021
- Hershberger JMorales N, Simoes CC, et al. Making waves in Breedbase : Un pipeline intégré de stockage et d'analyse de données spectrales pour les programmes sélection végétale . Plant Phenome J. 2021;4:e20012. https://doi.org/10.1002/ppj2.20012.
- Poland, J., Rife, T.B., Courtney, C., & Neilsen, M.. Intercross : An Android app for sélection végétale and genetics cross management. Crop Science. En cours de publication.
- Poland, J., Gore, M. A., Hershberger, J., Rife, T., Courtney, C. et Neilsen, M. (septembre 2021).Courtney, C., & Neilsen, M. (septembre 2021). Prospector : A mobile application for portable, high-throughput near-infrared spectroscopy phenotyping(e20024). The Plant Phenome Journal, 4(1), N/A. https://acsess.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ppj2.20024.
- Thavarajah, D., Thavarajah, P., Kumar, S., Johnson, N.Bridges, W., Shipe, E., & Boatwright, J. (juillet 2021). Genome-wide association mapping of lentil (Lens culinaris Medikus) prebiotic carbohydrates toward improved human health and crop stress tolerance(pp.1-12). Nature Food, 11(1), N/A. https://www.nature.com/articles/s41598-021-93475-3.
- Nathan Johnson†J Lucas Boatwright, William Bridges, Pushparajah Thavarajah, Shiv Kumar, Emerson Shipe, Dil Thavarajah‡, 2021. Cartographie d'association à l'échelle du génome des hydrates de carbone prébiotiques de la lentille (Lens culinaris Medikus) vers une meilleure santé humaine et une tolérance au stress des cultures. Rapports scientifiques, 11, 13926, https://doi.org/10.1038/s41598-021-93475-3.
- Amod Udayanga†Nathan Johnson†Pushparajah Thavarajah, Leung Tang, Dil Thavarajah‡, 2021. La spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier (FTIR) comme outil de phénotypage à haut débit pour quantifier la qualité des protéines dans les impulsions cultures, The Plant Phenome Journal. TPPJ-2021-08-0014-OR. En cours de révision.
- Dil Thavarajah‡Sarah Powers, Casey R. Johnson, George Vandermark, Pushparajah Thavarajah 2021. Biofortification des cultures de légumineuses vers la santé humaine - traits cibles glucides prébiotiques, protéines et micronutriments. In : Biofortification of staple cultures. Ed : Shiv Kumar, H.K.Dikshit, G.P.Mishra, et Akanksha Singh. Springer Nature.
- Merchan, K. (Avril 2021) amélioration des cultures ≠ sélection végétale: Comment le programme Feed the Future Laboratoire d'Innovation pour l'Amélioration des Cultures élargit l'engagement critique. CSA News Volume 6, numéro 5, p. 28-31. https://doi.org/10.1002/csan.20445
2020
- Nathan Johnson†. Casey Johnson, Pushparajah Thavarajah, Shiv Kumar, Dil Thavarajah‡ 2020. Les glucides prébiotiques de la lentille jouent un rôle essentiel dans la santé humaine et végétale. Plantes, Personnes, Planète. 00:1-10.
Présentations
2022
- Adikini, S. millet Pratiques de production, défis et opportunités en Afrique de l'Est. Présentation à la conférence "Harnessing the potential of millet for Achieving Food and Nutritional Security : Challenges and Prospects (ICFM-2022)". Conférence (virtuelle) à l'Université de Bangalore, Bangalore, Inde. Prononcé le 20 janvier 2022.
- Garner, E. et D. Rubin. 2021. "Développer les bases : Laboratoire d'Innovation pour l'Amélioration des Cultures (ILCI)." Présentation pour la conférence en ligne Cultivating Equality (12-15 octobre).
- Kampanje-Phiri, Jessica. "Innovation inclusive niébé Breeding au Malawi,"une présentation invitée à la réunion du conseil du laboratoire d'innovation 2022 à Washington, DC. Présenté le 21 septembre 2022.
- Brandon Monier, Bethany F. Econopouly, Terry M. Casstevens, Francisco J. Agosto-Pérez, Peter J. Bradbury, Edward S. Buckler. 2022. Cloudifier des analyses génétiques reproductibles : Intégration de TASSEL et de R avec JupyterHub. Présenté à la conférence cultures , Huntsvie, Alabama, 13-16 juin 2022.
- Morris, G. P. Comment adapter sorgho au changement climatique ? Les réseaux de sélection dirigés par les SNRA et de nombreuses petites expériences décisives. Séminaire en ligne Agrilinks. Livré le 10 février 2022.
- Puerto, S. A. Technology adoption in agriculture : a methods' review. Séminaire de recherche, groupe Miguel Gomez, Université Cornell. Prononcé le 23 septembre 2022.
- Tufan, H. A. Au-delà des "caractéristiques des femmes" : Analyse des différences entre les sexes et des différences sociales pour une conception inclusive des variétés de cultures. Présentation du panel pour la conférence Cultivating Equality 2021 (virtuelle), 14 octobre 2021.
- Tufan, H. A. Donner la priorité à l'égalité des sexes, de réflexion après coup à objectif directeur de l'innovation agricole. Présentation invitée, CALS Dean's Inclusive Excellence Seminar Series, Cornell University, Ithaca, NY. Présenté le 9 mars 2022.
- Tufan, H. A. Faire passer l'égalité des sexes du statut de réflexion après coup à celui d'objectif directeur de l'innovation agricole. Présentation de conférence invitée, Iowa State University, Ames, Iowa. Présentée le 24 mars 2022.
- Tufan, H. A. Shifting Gender Equality from Afterthought to Guiding Goal of Agricultural Innovation. Présentation invitée, réunion de l'initiative Market Intelligence du CGIAR, Nairobi, Kenya. Présenté en avril 2022.
2021
- Garner, E. (Oct. 2021). Le genre à travers les laboratoires d'innovation Feed the Future de l'USAID : Leçons et approches qui cultivent le développement agricole transformateur de genre. Conférence "Cultivating Equality".
- Kresovich, S. (Oct. 2021). La diversité future des banques de gènes végétaux : L'évolution de la gestion de la conservation des cultures. Discours liminaire à la conférence de l'Association africaine sélectionneurs .
- Tufan, H.A. (Oct. 2021). Au-delà des traits féminins : Analyser le genre et les différences sociales pour une conception variétale inclusive. Discours liminaire à la conférence de l'Association africaine sélectionneurs .
- Esters, L. (Oct. 2021). Déplacer l'aiguille sur la diversité STEAM à travers des partenariats de collaboration avec les institutions de service des minorités. Séminaire de la School of Integrative Plant Science, Cornell University.
- Kresovich, S., Rubin, D. Abraham, M., Robbins, K., Kane, N. (août 2021) Laboratoire d'Innovation pour l'Amélioration des Cultures (ILCI) : Vision et activités actuelles. Réunion annuelle de 2021 de la National Association of sélectionneurs .
- Tufan, H.A. sélection végétale for Equitable Futures. Session animée lors de la réunion annuelle de la National Association of sélectionneurs en 2021.
- Abraham, M. (août 2021). Mesure de capacité institutionnelle dans le cadre de Feed the Future Laboratoire d'Innovation pour l'Amélioration des Cultures (ILCI) : Facteurs influençant le gain génétique dans les programmes d'élevage. Présentation de conférence à l'Association nationale des sélectionneurs, virtuelle.
- Rubin, D. (août 2021). Thèmes transversaux et amélioration des cultures: Approche et activités de l'ILCI. Présentation de conférence à la réunion annuelle de la National Association of sélectionneurs , virtuelle.
- Mangheni, Margaret et al. (août 2021). Réflexions sur l'importance du contexte : Le genre et le soi, le lieu de travail et les disciplines agricoles. Série de webinaires sur les thèmes transversaux de l'ILCI.
- Mangheni, Margaret et al. (août 2021). Principes des méthodes mixtes et de la recherche qualitative. Série de webinaires sur les thèmes transversaux de l'ILCI.
- Rubin, Deborah. (Juin 2021). Recherche sur les questions de genre dans les chaînes de valeur agricoles pour amélioration des cultures. Série de webinaires sur les thèmes transversaux de l'ILCI.
- Forsythe, Lora. (Juin 2021) Donner un sens aux "données désordonnées" : Création de profils de produits alimentaires. Série de webinaires sur les thèmes transversaux de l'ILCI.
- Eluri, T. et Morris, G. (Fév. 2021). Identifier et combler les lacunes en matière de découverte des caractères. Webinaire de l'ILCI.
- Six présentations orales invitées phénologie pour des réunions internationales de recherche agricole
2020
- Tufan, H. A. La sélection sensible au genre : Des profils de produits socialement inclusifs aux systèmes transformateurs. Présentation à la Fondation Bill & Melinda Gates, 8 décembre 2020.
- Trois articles sur des conférences nationales et internationales, dont la réunion annuelle 2020 de l'ASA, de la CSSA et de la SSSA (9-13 novembre 2020) https://drive.google.com/file/d/1PYZh1w3H8h1WlOx9GHeq88wL-PTrG65Q/view?usp=sharing