L'atelier, Software Interoperability on the ILCI JupyterHub, s'appuie sur les compétences acquises lors de l'atelier précédent, Introduction to the ILCI JupyterHub. Dans la session 1, TASSEL et rTASSEL sont présentés avec une démonstration de rTASSEL dans JupyterHub pour les analyses génomiques. Dans la session 2, l'accent mis sur l'interopérabilité des logiciels se poursuit avec des instructions sur la manière de déplacer des objets entre rTASSEL et R et d'utiliser les appels BrAPI pour accéder à de grands fichiers de données par le biais de bases de données communes, telles que BMS et GIGWA. La prédiction génomique est réalisée en utilisant à la fois rTASSEL et le package R sommer pour démontrer la puissance de l'interopérabilité logicielle dans le JupyterHub.
L'objectif de cet atelier est de présenter aux utilisateurs les programmes logiciels disponibles dans le JupyterHub de l'ILCI et la manière dont les données volumineuses peuvent être directement accessibles dans le JupyterHub pour le calcul sans qu'il soit nécessaire de télécharger et d'envoyer ces fichiers volumineux.
