El taller, Software Interoperability on the ILCI JupyterHub, se basa en los conocimientos adquiridos en el taller anterior, Introduction to the ILCI JupyterHub. En la sesión 1, se introducen TASSEL y rTASSEL con una demostración de rTASSEL en JupyterHub para análisis genómicos. En la sesión 2, el enfoque en la interoperabilidad del software continúa con instrucciones sobre cómo mover objetos entre rTASSEL y R y utilizar llamadas BrAPI para acceder a grandes archivos de datos a través de bases de datos comunes, como BMS y GIGWA. La predicción genómica se realiza utilizando tanto rTASSEL como el paquete sommer de R para demostrar el poder de la interoperabilidad de software en el JupyterHub.
El objetivo de este taller es presentar a los usuarios los programas de software disponibles en el JupyterHub del ILCI y cómo se puede acceder directamente a los big data en el JupyterHub para realizar cálculos sin necesidad de descargar y cargar estos archivos de gran tamaño.
